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引言

医院、杭州医学院、中国临床肿瘤学会、中国甲状腺科普专委会、甲状腺科学会及德国默克共同举办的“武林新说——内分泌之甲状腺篇”已于7月4日线上火热召开,多位业内大咖齐聚盛会,学术内容异彩纷呈,一起来看看老师们的精彩分享~

临床蛋白质组学进展

及其在甲状腺结节诊断的应用

甲状腺结节是一种人群高发的疾病,从尸检的统计报告中显示,大约50%的人患有甲状腺结节,目前有10%左右甲状腺结节在体检的时候被发现。患有甲状腺结节的患者通常会进行细针穿刺,从细胞病理学上来看大部分都是良性,很少一部分为恶性。但是,此外有大约30%的结节无法明确诊断。对于无法诊断的甲状腺结节,大部分会被手术切除,而手术后的结节通过术后细致的病理诊断后发现,大约有80%的结节属于良性结节,在不压迫血管神经的情况下并不需要手术切除。这也是甲状腺癌过度诊断的原因之一。

蛋白质技术实现小样本高通量

提高检测速度及准确度

为了解决甲状腺癌过度诊断问题,郭天南团队从蛋白质角度入手,运用PCT(PressureCyclingTechnology)压力循环技术处理活检组织,实现小样本(~0.5mg)高通量检测,提速检测样品质量及速度。

与此同时,团队灵活运用DIA质谱分析法,结合深度学习建立模型,可以直接应用于临床的诊断预测。随着DIA蛋白组数据的质量和数量的增加,可以预见此技术在临床诊断中的潜力,将为甲状腺结节良恶性型诊断提供有效解决方案。

在甲状腺结节临床案例中,为了能够长久保存临床样本,多数是经过福尔马林固定、石蜡包埋的坚硬的柱状组织,因此从中提取足够的多肽是一大难题。

郭天南团队的PCT-DIA技术不仅适用于新鲜的组织样品处理,也适用于石蜡块、石蜡切片和石蜡柱,有效处理石蜡柱是团队开发的PCT独有特色。同先前的实验方法相比,这种技术不需要增加任何新的或特殊的试剂。在团队进一步优化试剂浓度后,使国产的胰酶效力毫不逊色进口产品,方法性价比非常高。

团队运用这项技术,采集来自于新加坡的个甲状腺组织的蛋白质组,同时通过机器学习建立一个区分甲状腺结节良恶性的模型。然后在另医院的个石蜡样本进行模型验证,综合准确率高达90.62%。随后医院进行了前瞻性的穿刺样本验证。最终结果显示,模型准确率大约在90%左右。利用PCT-DIA技术,有望协助临床医生提高甲状腺结节诊断的准确性。

本内容仅供医疗专业人士阅读

专家简介:郭天南

华中科技大学同济医学院毕业,武汉大学生物科学双学位,新加坡南洋理工大学博士学位。-年在瑞士苏黎世联邦理工大学RuediAebersold教授实验室从事博士后研究。年初在澳大利亚悉尼大学儿童医学研究所ProCan任ScientificDirector,肿瘤蛋白质组GroupLeader,悉尼大学医学院兼聘高级讲师。年8月加入西湖高等研究院任特聘研究员。长期从事蛋白质组学相关研究,并将其应用于大量的临床样本(包括甲状腺癌、前列腺癌等),结合人工智能探索生物标志物。

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